Работа отделения является важной частью клинического процесса. Ежедневно в госпитале проводятся эндоскопические исследования, хирургические операции, отделениям терапевтического профиля требуется верификация диагнозов с помощью биопсии – весь прижизненный материал пациентов, находящихся на лечении, поступает в патологоанатомическое отделение.

Отделение имеет широкие диагностические возможности: обследуется весь операционный материал удалённых тканей и органов, выполняется прижизненная морфологическая диагностика заболеваний по биопсийному материалу. Прижизненная патологоанатомическая диагностика позволяет в ранние сроки установить заболевания, в том числе онкологического профиля. Срочные диагностические исследования во время проведения хирургического вмешательств, в течение 20-30 минут, позволяют получить предварительный интраоперационный диагноз, что служит основанием в принятии решения врачом-хирургом об объёме дальнейшей операции. Посмертные гистологические исследования позволяют окончательно сформировать заключительный диагноз с установлением причин и механизмов смерти пациента. Ежегодно выполняется около 30 тысяч прижизненных патологоанатомических исследований операционного материала и около тысячи посмертных.

Технологический процесс полностью автоматизирован, что позволяет минимизировать сроки для установления окончательного диагноза, сократить время от момента получения лабораторией материала до медицинского заключения.

Оснащение отделения соответствует современным требованиям: имеется вакуумный аппарат закрытого типа для проводки материала, станция для заливки материала в парафиновые блоки, аппарат для окраски препаратов, роторные микротомы, современные бинокулярные микроскопы, ультрасовременный замораживающий микротом, для изготовления срочных прижизненных гистологических препаратов, аутостейнер с модулем и АРМом для проведения иммуногистохимических исследований и др. С целью минимизировать риски потерь и человеческий фактор в отделении внедрена электронная регистрация материалов, присвоение штрих-кодов.